Mae bioamrywiaeth—y we helaeth o fywyd sy'n cynnal ecosystemau a bodolaeth ddynol—dan fygythiad digynsail, ac mae amaethyddiaeth anifeiliaid ddiwydiannol yn un o'i brif ysgogwyr. Mae ffermio ffatri yn tanio datgoedwigo ar raddfa fawr, draenio gwlyptiroedd, a dinistrio glaswelltiroedd i greu lle i dda byw bori neu i dyfu cnydau porthiant monocwl fel soi a chorn. Mae'r gweithgareddau hyn yn darnio cynefinoedd naturiol, yn dadleoli rhywogaethau dirifedi, ac yn gwthio llawer tuag at ddifodiant. Mae'r effeithiau tonnog yn ddwys, gan ansefydlogi ecosystemau sy'n rheoleiddio hinsawdd, yn puro aer a dŵr, ac yn cynnal ffrwythlondeb pridd.
Mae'r defnydd dwys o wrteithiau cemegol, plaladdwyr a gwrthfiotigau mewn ffermio diwydiannol yn cyflymu dirywiad bioamrywiaeth ymhellach trwy wenwyno dyfrffyrdd, diraddio priddoedd, a gwanhau cadwyni bwyd naturiol. Mae ecosystemau dyfrol yn arbennig o agored i niwed, gan fod maetholion yn rhedeg i ffwrdd yn creu "parthau marw" wedi'u disbyddu gan ocsigen lle na all pysgod a rhywogaethau eraill oroesi. Ar yr un pryd, mae homogeneiddio amaethyddiaeth fyd-eang yn erydu amrywiaeth genetig, gan adael systemau bwyd yn fwy agored i blâu, clefydau, a sioc hinsawdd. Mae'r
categori hwn yn tanlinellu sut mae diogelu bioamrywiaeth yn anwahanadwy oddi wrth ailfeddwl ein dietau a'n harferion ffermio. Drwy leihau dibyniaeth ar gynhyrchion anifeiliaid a chofleidio systemau bwyd mwy cynaliadwy, sy'n seiliedig ar blanhigion, gall dynoliaeth leddfu pwysau ar ecosystemau, diogelu rhywogaethau sydd mewn perygl, a chadw'r cydbwysedd naturiol sy'n cynnal pob math o fywyd.
Mae ffermio ffatri yn ysgogydd blaenllaw diraddio amgylcheddol, gan gyfrannu at newid yn yr hinsawdd, datgoedwigo, llygredd dŵr, a cholli bioamrywiaeth. Mae'r system amaethyddol ddwys hon yn allyrru llawer iawn o nwyon tŷ gwydr fel methan wrth flinder adnoddau naturiol a dinistrio ecosystemau. Mae hefyd yn codi pryderon iechyd difrifol trwy or -ddefnyddio gwrthfiotigau a chyflyrau aflan sy'n meithrin achosion o glefydau. Gyda'i effaith eang ar iechyd y blaned a lles dynol, mae mabwysiadu arferion cynaliadwy fel ffermio adfywiol, dietau wedi'u seilio ar blanhigion, a chefnogi amaethyddiaeth leol wedi dod yn fwyfwy brys ar gyfer creu dyfodol iachach i'n planed
