גידול מפעל מייצר כמות מונומנטלית של סיכון לכוכב הלכת ולסביבה, והופך לשחקן מרכזי בהשפלת האקולוגיה ושינוי האקלים. בין ההשלכות הסביבתיות המשפיעות ביותר של חקלאות אינטנסיבית היא פליטת גזי חממה. גידול בעלי חיים, במיוחד מבקר, מייצר כמויות מאסיביות של מתאן - גז חממה אינטנסיבי השומר על חום באטמוספירה ביעילות רבה בהשוואה לפחמן דו חמצני. אז זהו גורם מרכזי נוסף התורם להתחממות כדור הארץ ומתן תאוצה לשינויי אקלים. ברחבי העולם, הפינוי המסיבי של יערות לרעה של בעלי חיים או לגידול גידולי מונוקולורה כמו פולי סויה ותירס למאכל בעלי חיים מציג צד חזק נוסף בחקלאות המפעל בגרימת יערות יערות. בנוסף להפחתת יכולתו של כדור הארץ לספוג פחמן דו חמצני, הרס יערות משבש גם את המערכות האקולוגיות ומאיים על המגוון הביולוגי על ידי השמדת בתי גידול לאינספור מינים. בנוסף, גידול מפעל מפנה משאבי מים קריטיים, מכיוון שיש צורך בכל כך הרבה מים לבעלי חיים, טיפוח גידולי הזנה וסילוק פסולת. השלכת פסולת בעלי חיים מלהימה בנהרות, אגמים ומי תהום עם חומרים מזיקים כמו חנקות, פוספטים ואורגניזמים בר -קיימא, מה שמוביל לזיהום מים והשרצה של אזורים מתים באוקיינוסים שבהם החיים הימיים אינם יכולים להתקיים. בעיה נוספת היא השפלה של אדמה כתוצאה מהדלדלות מזינה, שחיקה ומדבור בגלל ניצול יתר של אדמות לייצור הזנות. יתר על כן, השימוש הכבד בחומרי הדברה ודשנים הורס את המערכת האקולוגית שמסביב הפוגעת במאביקים, חיות בר וקהילות אנושיות. חקלאות מפעל לא רק פוגעת בבריאות על כדור הארץ, אלא גם מגדילה את הלחץ על משאבי הטבע ובכך עומדת בדרך של קיימות סביבתית. כדי להתמודד עם סוגיות אלה, מעבר למערכות מזון בר קיימא יותר הוא חיוני, אלה הכוללים שיקולים אתיים לרווחת אנוש ובעלי חיים ולסביבה עצמה.