Tehomaatalous on massiivinen terveydenuhka ihmisille, ja se johtuu huolimattomista ja likaisista toimista. Yksi vakavimmista ongelmista on antibioottien liikakäyttö karjassa, mikä on yleistä näissä tehtaissa taudin torjumiseksi ylikuormittuneissa ja stressaavissa olosuhteissa. Tämän voimakas käyttö johtaa bakteerien muodostumiseen, jotka ovat vastustuskykyisiä antibiooteille, jotka sitten siirtyvät ihmisiin suorassa kosketuksessa tartunnan saaneiden kanssa, saastuneiden tuotteiden kulutuksesta tai ympäristölähteistä, kuten vedestä ja maaperästä. Näiden ”superbakteerien” leviäminen on merkittävä uhka maailman terveydelle, koska se voi tehdä infektioista, joita hoidettiin helposti aiemmin, vastustuskykyisiä lääkkeille tai jopa parantumattomia. Lisäksi tehomaatilat luovat myös täydellisen ilmaston zoonoottisten patogeenien - eli eläimistä ihmisiin tarttuvien tautien - syntymiseen ja leviämiseen. Bakteerit, kuten Salmonella, E. coli ja Campylobacter, ovat likaisissa tehomaatiloissa eläviä mikrobeja, joiden leviäminen lisää niiden esiintymisen mahdollisuutta lihassa, munissa ja maitotuotteissa, aiheuttaen ruokavälitteisiä sairauksia ja epidemioita. Mikrobiriskien lisäksi tehomaataloudessa tuotetut eläintuotteet ovat usein runsaasti kyllästettyjä rasvoja ja kolesterolia, aiheuttaen useita kroonisia sairauksia, kuten lihavuutta, sydän- ja verisuonitauteja ja tyypin 2 diabetesta. Lisäksi karjan kasvuhormonien liiallinen käyttö on herättänyt huolta mahdollisista hormonihäiriöistä sekä pitkäaikaisista terveysvaikutuksista ihmisille, jotka kuluttavat näitä tuotteita. Tehomaatalouden aiheuttama ympäristön saastuminen vaikuttaa myös epäsuorasti lähiyhteisöjen terveyteen, koska eläinten jätteet voivat tunkeutua juomaveteen vaarallisten nitraattien ja bakteerien kanssa, aiheuttaen ruoansulatuskanavan ongelmia ja muita terveysongelmia. Nämä vaarat korostavat tarvetta välittömiin muutoksiin elintarvikkeiden tuotantotavoissa julkisen terveyden suojelemiseksi ja turvallisempien ja kestävien maatalousmenetelmien edistämiseksi.